BAJRANGI BHAIJAAN menceritakan tentang seorang gadis kecil yang tidak bisa berbicara namun dapat mendengar, anak ini berasal Pakistan bernama Shanida (Harshaali Malhotra) yang terpisah dengan ibunya saat sedang berada di stasiun kereta api di India. Gadis kecil yang kelaparan itu terus berjalan hingga tersesat hingga bertemu dengan seorang penganut agama Hindu yang baik hati bernama Payan yang lebih dikenal dengan Bajrangi (Salman Khan). Bajrangi sendiri berasumsi bahwa Shanida adalah seorang Hindu dan terpisah dari orangtuanya. Kemudian ia membelikan Shanida sebuah kalung Bajrang Bali untuk melindunginya dari bahaya. Dalam perjalanan menuju Delhi, Bajrangi memanggil Shanida dengan sebutan Munni dan mengujinya untuk memperoleh informasi dari mana Shanida berasal, namun Shanida tidak bereaksi terhadap setiap nama kota di India yang disebutkan. Sementara itu di dalam bus, Bajrangi menceritakan kisahnya bagaimana ia bertemu dengan Rasika (Kareena Kapoor), gadis yang ia cintai. Bajrangi telah berjanji pada ayah Rasika yang bernama Dayanand (Sharat Saxena) bahwa ia akan mengumpulkan uang untuk membelikan sebuah rumah untuk Rasika, agar ia dapat membuktikan dirinya sebagai mempelai pria yang layak. Bajrangi meyakinkan Rasika bahwa Munni akan tinggal bersama mereka sampai orangtua Munni ditemukan. Setelah beberapa lama, akhirnya Bajrangi mengetahui bahwa Munni adalah seorang Pakistan sekaligus seorang Muslim saat ia mendapatinya sedang memakan daging di rumah tetangganya. Bajrangi berusaha mengembalikan Munni ke rumahnya, meskipun harus melalui banyak rintangan, bahkan ia harus masuk ke Pakistan tanpa Visa.
